後龍山仔頂北極宮，乃禮奉北極玄天上帝之尊神也、其廟宇稽自明末、山崙中樹木蓊鬱，雜草繁殖，時有毫光發出，牧童見後，稟告兄長，反被訓為胡言。復有樵夫伐樹亦屢見之；其後風聞四起，疑是山神，且求之必應，故附近住民隨立草茅廟宇，用黏土塑成神像，奉祠為神。有一夜鄰 近諸民，夢見有位身穿紅袍，頭貸金冠之尊者，對他說：「明日正午，在中港渡溪有一根長尺半 ，廣八寸之沉香柴，在水中逆流可速取回雕我玄天上帝金身，勿違！」。附近住民夢中驚醒，所 夢皆同，於是諸民依命取回香柴雕刻金身號稱玄天上帝，然以神靈顯赫，香煙不絕。迨至嘉慶年間，有竹塹（今新竹)林府清江舍人(占梅) 蒙冤，被官差押往台南府面審，路經本宮廟前，清江 舍人於囚車內暗中祈禱曰：「吾乃被誣，若得神明庇祐，無事回家，願以磚瓦改造新廟宇」；心 願出神靈知，冤屈果獲洗雪，無罪開釋。林舍人為酬謝神因，將舊草茅廟宇改建為磚瓦廟宇。
迨 至道光戊申年，林府清江舍人為國有功\，欽賜道台官銜，於此年季春再來增築東西方兩廊，並掛 扁『愷澤覃敷』四個字在本宮殿前，留作紀念。迨至民國乙亥年，兩次大地震，廟宇全部倒塌， 越至民國丁丑年，幸蒙遐邇善男信女誠心捐獻，於己卯年陽月興工重建。
宮殿的各種設施均經精 心設計頗稱優美，緣以神靈，常有病人來廟求醫靜養，於是再建靜養堂一座。為參香客納涼休息 起見，在本宮西北方又建貴山亭一座，前面大花園中有噴水池，四季花開，萬紫千紅，景色宜人 。己巳年為了迎合大量香客之需，興建東側三百坪之香客大樓，樓上住宿房間，樓下為餐\廳。甲 戍年復將靜養堂拆除重建西側香客大樓，樓上奉祀皇宮媽、文昌帝君、財神爺及住宿套房，庚辰 年增闢平安里斗斗殿、五文昌殿。
於己卯年竣工落成後的五門、迴廊、金亭更呈現出北極宮金碧 輝煌、典雅雄偉、莊嚴肅穆的全貌。前有三千坪停車場，宮後有兩公頃餘土地由觀光局資助開闢 成一處多元化的休息園區。園中珍貴花木、鮮美芳草、繞山步道、落葉繽紛、風景幽麗，是一處宗教信仰活動中，兼具休閒娛樂、陶冶心靈的聖地。北極宮聯外交通四方八達非常便利，尤以中 二高大山交流道的開通，距離本宮僅一百公尺，這對參香團暨休閒踏青群眾更為便捷。
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